子宮內(nèi)膜異位癥部分患者沒有臨床癥狀,有臨床癥狀會表現(xiàn)為疼痛、月經(jīng)異常和不孕癥。疼痛是內(nèi)異癥最主要的癥狀,可能會表現(xiàn)為痛經(jīng)、慢性盆腔痛、性交痛,嚴(yán)重的會影響生活質(zhì)量。對于卵巢巧克力囊腫破裂的患者可能會出現(xiàn)急腹痛,約有15%-30%的患者可能會有月經(jīng)量增多、經(jīng)期延長以及月經(jīng)淋漓不盡。子宮內(nèi)膜異位癥患者當(dāng)中不孕癥的比例高達(dá)50%以上,是女性不孕的常見原因之一。還有些特殊部位內(nèi)異癥可能會有其它后果,比如說腸道內(nèi)異癥可能會出現(xiàn)腹痛、腹瀉或者便秘,甚至是周期性血便。膀胱內(nèi)異癥可能會出現(xiàn)尿頻、尿痛和血尿,內(nèi)異癥侵犯和壓迫輸尿管時可以出現(xiàn)一側(cè)的腰痛或者血尿。對于巧克力囊腫的患者,有可能會有囊腫惡變的可能,最常見的有卵巢子宮內(nèi)膜樣癌和卵巢透明細(xì)胞癌。