男性生殖器畸形的治療主要以手術治療為主,中醫(yī)治療生殖器畸形沒有效果。治療方法主要包括:1.先天性無陰莖畸形,對于此患者最好的治療方案是轉歸為女性,建議通過做睪丸切除及外陰成形的手術治療。2.隱匿性陰莖畸形,這種情況要對患者進行綜合性減肥治療,在必要時可以進行陰莖成形手術,建議兒童患者應在青春期前完成手術。3.雙陰莖畸形,對于此種癥狀可保留患者粗壯的一側而將另一側切除。4.大陰莖畸形,可對患者采用部分切除陰莖海綿體的縮小手術。生殖器畸形有很多類型,由于類型不同,因此在治療的時候選擇的方法也不同。